Ομικρον – Εκτίναξη στην Αττική – Επικράτησε μετά από δύο εβδομάδες στο 87%
Επικράτηση της παραλλαγής Όμικρον στην Αττική, σε ποσοστό 87% με ταυτόχρονη σημαντική μείωση του στελέχους Δέλτα, “βλέπει” το ΕΚΠΑ το οποίο έχει αναπτύξει μια νέα μοριακή μεθοδολογία ευαίσθητης ανίχνευσης και ποσοτικού προσδιορισμού των μεταλλαγμένων στελεχών/παραλλαγών του SARS-CoV-2 σε δείγματα λυμάτων με χρήση μιας σειράς μοριακών μεθόδων και αλληλούχηση επόμενης γενιάς (Next Generation Sequencing/NGS). Μάλιστα όπως επισημαίνεται πριν από δύο εβδομάδες το ποσοστό
Στο Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών (ΕΚΠΑ), μέσω της συνεργασίας Ερευνητικών Μονάδων των Τμημάτων Βιολογίας, Ιατρικής και Χημείας, στο πλαίσιο έρευνας με επιστημονικό υπεύθυνο τον Καθηγητή Ανδρέα Σκορίλα και διεπιστημονική ομάδα του ΕΚΠΑ που αποτελείται από τους Νικόλαο Θωμαΐδη, Μαργαρίτη Αυγέρη, Αθηνά Μάρκου, Εύη Λιανίδου, Δημήτριο Γουργιώτη, Θεοδώρα Ψαλτοπούλου, Παναγιώτη Αδαμόπουλο, Μάριο Διαμαντόπουλο, Λάμπρο Δημητρακόπουλο, Κατερίνα Γαλάνη, Μάριο Κωστάκη, Κατερίνα Κοντού, Βασίλη Καπέ, Νικόλαο Βούλγαρη και Θάνο Δημόπουλο (Πρύτανης ΕΚΠΑ), έχει αναπτυχθεί νέα μοριακή μεθοδολογία ευαίσθητης ανίχνευσης και ποσοτικού προσδιορισμού των μεταλλαγμένων στελεχών/παραλλαγών του SARS-CoV-2 σε δείγματα λυμάτων με χρήση μιας σειράς μοριακών μεθόδων και αλληλούχηση επόμενης γενιάς (Next Generation Sequencing/NGS).
Επιτήρηση νέων παραλλαγώνΗ συγκεκριμένη υπερευαίσθητη μεθοδολογία είναι ιδιαίτερα σημαντική διότι δείχνει την παρουσία και την εκατοστιαία αναλογία των μεταλλαγμένων στελεχών στο σύνολο του πληθυσμού μιας πόλης. Επιπλέον, ανιχνεύει έγκαιρα, ακόμη και από 50ml λύματος ή οποιουδήποτε περιβαλλοντικού δείγματος, νέες μεταλλάξεις και στελέχη/παραλλαγές που μόλις άρχισαν να εισέρχονται στον πληθυσμό. Με τον τρόπο αυτό γίνεται με μεγαλύτερη ευκολία και αξιοπιστία η γονιδιωματική επιτήρηση των νέων στελεχών/παραλλαγών του SARS-CoV-2, καθώς και άλλων ιών ή βακτηρίων, δίνοντας την αναγκαία πληροφόρηση για την επιδημιολογική επιτήρηση καθώς και τον ανασχεδιασμό των νέων εμβολίων και φαρμακευτικών πρωτοκόλλων. Το σχετικό άρθρο δημοσιεύτηκε στο έγκριτο διεθνές επιστημονικό περιοδικό “International Journal of Molecular Sciences”, ενώ έχει κατατεθεί από το ΕΚΠΑ αίτηση για χορήγηση Εθνικού και Διεθνών Διπλωμάτων Ευρεσιτεχνίας.
Διαβάστε επίσης: Λύματα – Στο 90% του ιικού φορτίου η μετάλλαξη OμικρονΗ μεθοδολογία πληροί τις προϋποθέσεις τής από 15-3-2021 σχετικής σύστασης της Ευρωπαϊκής Επιτροπής για την κοινή προσέγγιση κατά τη δημιουργία συστηματικής επιτήρησης του SARS-CoV-2 και των παραλλαγών του στα λύματα. Επιπροσθέτως, ανιχνεύει εγκαίρως νέα στελέχη/παραλλαγές που αρχίζουν να εισέρχονται στην κοινότητα.
Τι έδειξαν τα λύματαΜε την εφαρμογή της νέας μεθοδολογίας έχει ολοκληρωθεί η ανάλυση μεταλλαγμένων στελεχών του SARS-CoV-2 σε δείγματα λυμάτων της Περιφερειακής Ενότητας Αττικής, που συλλέχθηκαν σε καθημερινή βάση κατά το διάστημα 27-12/2021 έως 1-1-2022 από το Κέντρο Επεξεργασίας Λυμάτων της Ψυττάλειας (ΚΕΛΨ). Τα συγκεκριμένα δείγματα υπεβλήθησαν σε έλεγχο ειδικών μεταλλάξεων – γενετικών δεικτών (genetic markers) ολόκληρου του γονιδίου S (Spike) (>100 γενετικοί δείκτες) για τις παραλλαγές ειδικού ενδιαφέροντος (Variants οf Concern – VOC) και τις παραλλαγές υπό διερεύνηση (Variants οf Interest – VOI).
Τα αποτελέσματα της ανάλυσης ανέδειξαν την επικράτηση, σε ποσοστό 87% με σημαντική πολυμορφία, της παραλλαγής Omicron (B.1.1.529 lineage) και την ταυτόχρονη σημαντική μείωση των αντίστοιχων γενετικών δεικτών του στελέχους Delta (B.1.617.2 lineage).
Πιο συγκεκριμένα, διαπιστώθηκε η παρουσία ειδικών μεταλλάξεων (genetic markers) του γονιδίου S (Spike) της παραλλαγής Omicron (B.1.1.529 lineage):– στο τμήμα “receptor-binding domain/RBD” σε ποσοστό 87% (γενετικοί δείκτες: G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S)
– στο τμήμα “receptor-binding motif/RBM” σε ποσοστό 29% (γενετικοί δείκτες: S477N, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H)
– εκτός των RBD/RBM τμημάτων σε ποσοστό 45% (γενετικοί δείκτες: T547K, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F)
Ταυτόχρονα διαπιστώθηκε, για πρώτη φορά, η παρουσία δύο στελεχών της παραλλαγής Omicron, τα οποία φέρουν (συγχαρτογραφούνται) επιπλέον μεταλλάξεις, και συγκεκριμένα:– η μετάλλαξη R346K (B.1.1.529+R346K), σε ποσοστό 27%, η οποία έχει αναφερθεί στην παραλλαγή Mu (B1.621)
– η μετάλλαξη A701V (B.1.1.529+A701V), σε ποσοστό 5%, η οποία έχει αναφερθεί στην παραλλαγή Beta (B1.351)
Συνδυασμοί διαφορετικών μεταλλάξεωνΜε βάση τα ανώτερα αποτελέσματα διαπιστώνεται η επικράτηση της παραλλαγής Όμικρον στην Αττική (σε ποσοστό 87% από
- Δημοφιλέστερες Ειδήσεις Κατηγορίας Ειδήσεις
- Από μόνος του προκάλεσε ο Νόβακ. Γεμάτος έπαρση, ήθελε να είναι η εξαίρεση στον κανόνα!
- Κολοτούμπες της κυβέρνησης όπου εντείνονται οι αντιδράσεις
- Θεσσαλονίκη – Πετάνε στο δρόμο δύο αδελφές για ένα σκύλο
- Κορωνοϊός: Γιατί κολλάνε Omicron και οι εμβολιασμένοι; – Η επιστήμη απαντά
- Σταμάτης Γονίδης: «Θα ήθελα πολύ να μπω στην 5η διάσταση αλλά αργεί ακόμα, θα μπούμε όλοι μαζί»
- Παγώνη: Αδύνατο όσοι νοσούν με κορονοϊό να γυρίσουν στη δουλειά τους την 6η μέρα
- 7 αγελαδοτρόφοι από την Αργολίδα και την Αρκαδία συνασπίστηκαν και έφτιαξαν ένα εξαιρετικό γάλα
- Αργίες 2022: Καθαρά Δευτέρα η επόμενη ευκαιρία για ξεκούραση – Πότε πέφτει
- ΕΚΠΑ: Κυρίαρχη η παραλλαγή Όμικρον στην Αττική κατά 87% με σημαντική πολυμορφία
- Σασμός: Η Αργυρώ κοντά στον θάνατο - Συγκλονιστικές εξελίξεις
- Δημοφιλέστερες Ειδήσεις Τα Νεα
- ΕΟΔΥ – Πού και ποιες ώρες μπορείτε να κάνετε δωρεάν rapid test την Παρασκευή 7 Ιανουαρίου
- Τα περιστατικά άνοιας στην Ελλάδα προβλέπεται να αυξηθούν κατά 45% έως το 2050 – Θα τριπλασιασθούν στον κόσμο
- Κοροναϊός – Επιστράτευση ιδιωτών γιατρών και νέα μέτρα μετά τις 16 Ιανουαρίου
- Θα μπει «στοπ» στο πρωτάθλημα;
- Ομικρον – Εκτίναξη στην Αττική – Επικράτησε μετά από δύο εβδομάδες στο 87%
- Το μήνυμα της συζύγου του Τζόκοβιτς για την «αιχμαλωσία»
- Περού – Πρώτος θάνατος από «flurona»
- Ανατιμήσεις σε ρεύμα και φυσικό αέριο – Νέα μέτρα στήριξης νοικοκυριών και επιχειρήσεων ανακοινώνει ο Σκρέκας
- Πανδημία – Πάνω από 300 εκατ. τα κρούσματα σε όλο τον κόσμο
- Τζανάκης – Είναι νωρίς να μιλάμε για ενδημική νόσο
- Τελευταία Νέα Τα Νεα
- Ομικρον – Εκτίναξη στην Αττική – Επικράτησε μετά από δύο εβδομάδες στο 87%
- Τα περιστατικά άνοιας στην Ελλάδα προβλέπεται να αυξηθούν κατά 45% έως το 2050 – Θα τριπλασιασθούν στον κόσμο
- Το μήνυμα της συζύγου του Τζόκοβιτς για την «αιχμαλωσία»
- Τζανάκης – Είναι νωρίς να μιλάμε για ενδημική νόσο
- Κοροναϊός – Επιστράτευση ιδιωτών γιατρών και νέα μέτρα μετά τις 16 Ιανουαρίου
- Θα μπει «στοπ» στο πρωτάθλημα;
- Πανδημία – Πάνω από 300 εκατ. τα κρούσματα σε όλο τον κόσμο
- Επίδομα 250 ευρώ σε χαμηλοσυνταξιούχους – Τι να κάνουν όσοι δεν τα έλαβαν
- Περού – Πρώτος θάνατος από «flurona»
- ΕΟΔΥ – Πού και ποιες ώρες μπορείτε να κάνετε δωρεάν rapid test την Παρασκευή 7 Ιανουαρίου
- Τελευταία Νέα Κατηγορίας Ειδήσεις
- Τρομάζει η εξάπλωση του κορονοϊού στα Χανιά με 5.000 ενεργά κρούσματα και 71 νοσηλείες
- Πορτοσάλτε για Τζόκοβιτς: «Απέχουμε πολύ από το να γίνουμε Αυστραλία»
- Έργο Κωστή Χατζηδάκη: Ένας χρόνος στο υπουργείο Εργασίας
- Αιτωλοακαρνανία: Εξελίξεις για τον εργάτη που αγόρασε πλαστικό δοχείο που έκρυβε 50.000 ευρώ
- Αποστολή στη Φλώρινα: Εδώ χτυπά η καρδιά των Βαλκανίων
- Σασμός: Ο Αστέρης πυροβολεί και σκοτώνει τον Πετρή
- Μετάλλαξη Omicron: Κυρίαρχη στην Αττική σε ποσοστό 87% - Τι δείχνουν τα λύματα
- ΒΙΝΤΕΟ: Μεγάλη νίκη των Νικς στο «θρίλερ» με τους Σέλτικς - Αποτελέσματα και κατάταξη στο NBA
- Τσουχτερό πρόστιμο σε ιδιοκτήτη καφέ – μπαρ στην Κρήτη που εξυπηρετούσε εννέα ανεμβολίαστους πελάτες
- «Ψηφιακός Ιστορικός Χάρτης της Κρήτης: 1821-1830» για τα σχολεία της Κρήτης