Διεπιστημονική ομάδα ΕΚΠΑ: Αναλυτικές μεθοδολογίες ανίχνευσης του SARS-CoV-2 στα λύματα
Με έναυσμα την εν εξελίξει πανδημία που οφείλεται στον SARS-CoV-2, διεπιστημονική ομάδα του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών (ΕΚΠΑ), προέβη στη βιβλιογραφική ανασκόπηση και καταγραφή των μεθοδολογιών προσδιορισμού του ιικού φορτίου στα λύματα.
Η ερευνητική κοινότητα του ΕΚΠΑ καθοδηγείται από τον καθηγητή Αναλυτικής
Σκοπός είναι να συμβάλλει στην αναχαίτιση της πανδημίας. Μέσω της διεπιστημονικής προσέγγισης, της ανταλλαγής γνώσεων και εμπειρίας των ερευνητικών ομάδων του ΕΚΠΑ και της ενδελεχούς προσπάθειας, οι εργασίες που έπονται θα συνδράμουν σημαντικά στην κατανόηση της παρούσας γνώσης και θα την τροφοδοτήσουν με νέα, ενώ παράλληλα θα προσφέρουν χρήσιμα όπλα για την πρόληψη, τον περιορισμό και την αντιμετώπιση της πανδημίας.
Το άρθρο συνοψίζει τις υπάρχουσες μεθοδολογίες που έχουν εφαρμοστεί σε παγκόσμια κλίμακα και δημοσιεύτηκε στο διεθνούς φήμης και μεγάλης απήχησης (Impact Factor 9.8) περιοδικό Trends in Analytical Chemistry.
Αφορμή αποτέλεσε η καθημερινή παρακολούθηση του ιικού φορτίου του SARS-CoV-2 στα αστικά λύματα του Κέντρου Επεξεργασίας Λυμάτων (ΚΕΛ) της Ψυττάλειας (ΕΥΔΑΠ), που πραγματοποιείται από το Εργαστήριο Αναλυτικής Χημείας για την καταγραφή της διασποράς της νόσου COVID-19 στο λεκανοπέδιο Αττικής.
Τα αποτελέσματα υποβάλλονται καθημερινά στη Γενική Γραμματεία Δημόσιας Υγείας και στην Επιτροπή Εμπειρογνωμόνων του υπουργείου Υγείας.
Από την προαναφερθείσα ανασκόπηση και την καταγραφή είναι έκδηλη η ανάγκη παρακολούθησης της εξέλιξης της πανδημίας, μέσω μη παρεμβατικών και με χαμηλό κόστος εργαλείων, όπως η Επιδημιολογία Λυμάτων. Με την εφαρμογή αυτής της μεθοδολογίας αναπτύσσεται ένα σύστημα έγκαιρης και έγκυρης προειδοποίησης, που αποτελεί αρωγό των αρμόδιων Αρχών στη λήψη σωστών αποφάσεων την κατάλληλη στιγμή.
Οι συνθήκες φύλαξης των δειγμάτων, τα στάδια προσυγκέντρωσης και απομόνωσης του ιικού φορτίου είναι ιδιαίτερα κρίσιμα και πρέπει να ελέγχονται με εξωγενή πρότυπα και πειράματα επικύρωσης, ώστε να πραγματοποιείται ο έλεγχος ποιότητας της μεθοδολογίας και να εξασφαλίζεται η αξιοπιστία των αποτελεσμάτων.
Η ανίχνευση του ιικού φορτίου πραγματοποιείται με την τεχνική της RT-qPCR, η οποία παρέχει υψηλή ευαισθησία και απόδοση με χαμηλό κόστος. Λόγω της πολυπλοκότητας του αντικειμένου και της άμεσης ανάγκης για ευαίσθητες και αξιόπιστες μεθοδολογίες, απαιτείται περαιτέρω έρευνα για τη βελτίωση των κομβικών σημείων που επηρεάζουν την ανάλυση.
Η εργασία που δημοσιεύτηκε από τη διεπιστημονική ομάδα του ΕΚΠΑ αποτελεί εφαλτήριο και προαπαιτούμενη γνώση για τις έρευνες που εκπονούνται όσον αφορά την ανίχνευση του SARS-CoV-2 στα λύματα. Παράλληλα, διενεργούνται σημαντικές ερευνητικές προσπάθειες σε πολλές ακαδημαϊκές μονάδες του ΕΚΠΑ.
Οι επόμενες εργασίες σχετικά με την παρουσία του SARS-CoV-2 στα λύματα αφορούν:
Την ανάπτυξη και επικύρωση νέου μοντέλου υπολογισμού των μολύνσεων από SARS-CoV-2 στην περιφέρεια της Αττικής σε καθημερινή βάση από τα λύματα.Την ανάπτυξη πρωτότυπων και υπερευαίσθητων νέων μοριακών μεθοδολογιών για την ανίχνευση και αλληλούχηση του ιού SARS-CoV-2 σε αστικά λύματα και σε κλειστές δομές, οι οποίες αναμφισβήτητα αποτελούν εστίες υπερμετάδοσης (υπό τον συντονισμό του καθηγητή Κλινικής Βιοχημείας Ανδ. Σκορίλα).Την ανάπτυξη μίας πολλαπλής RT-ddPCR με σκοπό την άμεση, απόλυτη ποσοτικοποίηση του αριθμού των αντιγράφων του ιού σε κλινικά δείγματα χωρίς την ανάγκη εξωτερικής βαθμονόμησης (υπό τον συντονισμό της καθηγήτριας Αναλυτικής και Κλινικής Χημείας Ε. Λιανίδου). Η droplet digital PCR (ddPCR) αποτελεί μία εξελιγμένη τεχνική ποσοτικής PCR με πολλά πλεονεκτήματα ως προς την αναλυτική ευαισθησία. Το κύριο πλεονέκτημα της αναπτυσσόμενης πολλαπλής RT-ddPCR έναντι της RT-qPCR είναι η πολύ καλή ειδικότητα και η ακρίβεια στον ποσοτικό προσδιορισμό σε πολύ χαμηλά επίπεδα συγκεντρώσεων ιικού φορτιού.Την εφαρμογή μεθοδολογιών με ddPCR για την ποσοτικοποίηση των αντιγράφων του SARS-CoV-2 που βρίσκονται στα λύματα με χαμηλό ιικό φορτίου λόγω της υψηλής ευαισθησίας και ακρίβειαά της.www.ert.gr
- Δημοφιλέστερες Ειδήσεις Κατηγορίας Ειδήσεις
- Πίστευε ότι δεν υπάρχει και έφυγε από κοροναϊό. Τον έφαγαν οι συνωμοσιολόγοι, λένε η γυναίκα του και οι φίλοι του
- Μακελειό στο Βύρωνα: Αποζημίωση 410.000 ευρώ για το θάνατο του Νίκολα Τόντι
- Το παρασκήνιο της αποχώρησης της Έλενας Χριστοπούλου από τον ΣΚΑΙ
- Κορωνοϊός - Σέρρες: Ο 25χρονος απομονώθηκε όταν έμαθε ότι νόσησε - «Δεν άντεξε η καρδιά του», λέει ο αδερφός του
- Μείωση στα κρούσματα ή στα τεστ; Γιατί έχουμε πολύ δρόμο μπροστά μας...
- The Bachelor: Παίκτρια ήταν πρωταγωνίστρια ταινιών για ενήλικους (pics)
- Η Αναστασία Κατηφόρη ξαφνιάστηκε όταν έμαθε ότι είναι η γενική κληρονόμος της Νανάς Καραγιάννη
- Στα 19 τα νέα κρούσματα κορονοϊού στην Ήπειρο – Αναλυτικοί πίνακες
- DW: Η Γερμανία πούλησε στην Τουρκία πολεμικά πλοία αξίας 1,5 δισ. ευρώ μέσα σε 16 χρόνια
- Κορωνοϊός: Έτοιμοι για τη "μάχη" της Θεσσαλονίκης 170 ιδιώτες γιατροί
- Δημοφιλέστερες Ειδήσεις ΕΡΤ
- Μακελειό στο Βύρωνα: Αποζημίωση 410.000 ευρώ για το θάνατο του Νίκολα Τόντι
- Στα 19 τα νέα κρούσματα κορονοϊού στην Ήπειρο – Αναλυτικοί πίνακες
- Παραδόθηκε η τελική έκθεση της Επιτροπής Πισσαρίδη – Οι 20 στόχοι για την ανάπτυξη της ελληνικής οικονομίας
- Κλοπ: «Σε λίγο δεν θα συμπληρώνουμε… ενδεκάδα»
- Κέρκυρα: Αντιδράσεις από την Κάτω Κορακιάνα για το οικόπεδο της IKOS
- Αν. Μακεδονία-Θράκη: 94 νέες μολύνσεις SARS-COV 2 – Αναλυτικοί πίνακες
- Π.Ε. Σερρών: 43 τα νέα κρούσματα covid-19
- Δήμος Ηράκλειας: Διακοπές ρεύματος
- Κέρκυρα: Γραμμή ψυχολογικής στήριξης από το Δήμο Κεντρικής Κέρκυρας
- Πως ανιχνεύεται ο κορονοϊός στα λύματα της Θεσσαλονίκης (video)
- Τελευταία Νέα ΕΡΤ
- Διεπιστημονική ομάδα ΕΚΠΑ: Αναλυτικές μεθοδολογίες ανίχνευσης του SARS-CoV-2 στα λύματα
- Κλοπ: «Σε λίγο δεν θα συμπληρώνουμε… ενδεκάδα»
- Σαρλ Μισέλ: Είναι η ώρα ΕΕ και ΗΠΑ να ενώσουν τις δυνάμεις τους
- Παραδόθηκε η τελική έκθεση της Επιτροπής Πισσαρίδη – Οι 20 στόχοι για την ανάπτυξη της ελληνικής οικονομίας
- Π.Ε. Σερρών: 43 τα νέα κρούσματα covid-19
- Στα 19 τα νέα κρούσματα κορονοϊού στην Ήπειρο – Αναλυτικοί πίνακες
- Στα 33 τα κρούσματα κορονοϊού τη Δευτέρα στην Κρήτη
- Ηνωμένο Βασίλειο: Νέο σύστημα με μαζικά τεστ και τοπικά lockdown
- Κέρκυρα: Γραμμή ψυχολογικής στήριξης από το Δήμο Κεντρικής Κέρκυρας
- Βουλευτές – Γιατροί στη «μάχη» κατά του κορονοϊού (video)
- Τελευταία Νέα Κατηγορίας Ειδήσεις
- Ερευνα – ανατροπή για τον κορωνοϊό : Ποιο το καλύτερο όπλο – Πότε η μάσκα είναι «ανίσχυρη»
- Πατέρας Μελίνας Παρασκάκη: "Κάθε φορά στη δίκη βιώνω την κηδεία της"
- Το «μυστικό» ραντεβού του Νετανιάχου με τον πρίγκιπα Μοχάμεντ μπιν Σαλμάν και τον Πομπέο
- Super League 1 live, Βόλος-ΟΦΗ 0-1 (Β' ημίχρονο)
- «Έτοιμο εντός της εβδομάδας το ΚΥΜΕΑ στον εξωτερικό χώρο του 424 ΓΣΝΕ»
- Ο Τζο Μπάιντεν προτείνει τον Άντονι Μπλίνκεν για επικεφαλής του Στέιτ Ντιπάρτμεντ
- Ιταλία: 22.930 κρούσματα και 630 θάνατοι σε 24 ώρες
- Πρόστιμα-σοκ στα e-ποδήλατα με «μαϊμού» πιστοποιητικά!
- Ξεκάθαρο μήνυμα Παπαευαγγέλου: «Η covid-19 δεν είναι γρίπη»
